Качество усвоения программы обучения контролируется городскими диагностическими работами, которые проводятся в два этапа. Материалы для диагностических работ, регламент их проведения и саму процедуру готовят специалисты Московского центра качества образования (МЦКО) (ссылка на демонстрационные версии заданий http://mcko.ru/pages/m_n_d_i-m_materials).